El otrora famoso y respetado científico Zorndyke ha creado un nuevo género de seres vivos, uno que prospera en los océanos y vive para destruir a los humanos. Zorndyke cree que es hora de que los humanos sean relevados de su dominio sobre la tierra. Depende del Submarino Azul No. 6 y del resto de la flota Azul poner fin a la locura y las creaciones de Zorndyke.
Ao no 6-gou ganó el premio Packaged Work Award en los Animation Kobe Awards de 1999.