Submarine Super 99 es un anime de ciencia ficción y aventura que se desarrolla en un futuro cercano, donde los océanos han sido colonizados y se han convertido en el nuevo campo de batalla de diferentes facciones políticas y militares. La historia se centra en el protagonista, Hayami Tetsu, un piloto de submarinos talentoso y apasionado. Su objetivo es convertirse en el mejor piloto de submarinos y encontrar una misteriosa ciudad submarina conocida como “Slider 53”.
La trama comienza cuando Hayami recibe el encargo de pilotar el Super 99, un submarino experimental de última generación. A bordo del Super 99, Hayami inicia una serie de misiones peligrosas en las que debe enfrentarse a enemigos poderosos y resolver los secretos ocultos en los abismos marinos.
A medida que avanza la historia, Hayami se encuentra con diferentes personajes que se unen a su tripulación, cada uno con habilidades y motivaciones únicas. Entre ellos se encuentran Yuri, una valiente piloto de combate; Kenichi, un experto en tecnología submarina; y Gorou, un exmilitar retirado que se convierte en el mentor de Hayami.
A lo largo de la trama, el equipo de Hayami se enfrenta a numerosos desafíos, incluyendo combates contra submarinos enemigos, exploración de ruinas submarinas y el descubrimiento de criaturas marinas gigantes y desconocidas. Además, se revela que Slider 53 es una antigua ciudad submarina que contiene tecnología avanzada y secretos que podrían cambiar el destino de la humanidad.
A medida que Hayami y su equipo se acercan a la verdad detrás de Slider 53, también deben lidiar con las conspiraciones políticas que amenazan con desencadenar una guerra global en los océanos. Enfrentado tanto a enemigos externos como internos, Hayami lucha por proteger a sus amigos y cumplir su objetivo de descubrir la verdad detrás de Slider 53.
A medida que se desarrolla la historia, Submarine Super 99 explora temas como la amistad, el coraje, la lealtad y el sacrificio. A través de emocionantes secuencias de acción submarina, intriga política y sorpresas constantes, la serie mantiene al público en vilo mientras Hayami y su tripulación se adentran en lo desconocido en busca de respuestas y desafían las adversidades para enfrentarse a su destino.