Durante siglos, la humanidad ha sido perseguida por depredadores gigantes y misteriosos conocidos como los Titanes. Tres poderosos muros, Wall Maria, Rose y Sheena, brindaron paz y protección a la humanidad durante más de cien años. Sin embargo, esa paz se hizo añicos cuando aparecieron el Titán Colosal y el Titán Acorazado y destruyeron el muro exterior, el Muro María. Obligada a retirarse detrás de Wall Rose, la humanidad esperó con gran expectación a que los titanes reaparecieran y destruyeran su refugio seguro una vez más.
En la temporada 2 de Shingeki no Kyojin, Eren Yeager y otros miembros del 104.° cuerpo de entrenamiento acaban de comenzar a convertirse en miembros de pleno derecho del cuerpo de reconocimiento. Mientras se preparan para enfrentarse a los Titanes una vez más, sus preparativos se ven interrumpidos por la invasión de Wall Rose, pero no todo es lo que parece a medida que se desentrañan más misterios. Mientras Survey Corps corre para salvar el muro, descubren más sobre los titanes invasores y los oscuros secretos de sus propios miembros.
Shingeki no Kyojin Season 2 adapta el contenido de los volúmenes 9-12 del galardonado manga de Hajime Isayama.